光子嫩肤的不良反应很少见，经验丰富的医生操作时不会发生不良反应。常见的不良反应包括红肿、疼痛、干燥、爆痘、瘙痒、水疱、色沉、色脱和复黑。应该在治疗前增强皮肤耐受性，治疗后做好保湿防晒，避免暴晒。若出现不良反应，应根据情况采取不同的处理方法，可以使用皮秒、超皮秒激光、外用药物等缓解症状，复黑需要长期的治疗。